發(fā)布日期：2017-01-05

Perthera是由喬治梅森大學(xué)研究人員Emanuel Petricoin和風(fēng)投家Dendy Young在2013年創(chuàng)立的個體化醫(yī)療公司。Perthera本身并不做實(shí)驗(yàn)分析，而是作為中間收集和運(yùn)送腫瘤患者樣本的經(jīng)銷商，幫助醫(yī)生從分子檢測公司獲取基因組、蛋白組等信息。同時，Perthera也在建立一個患者治療史和檢測結(jié)果的數(shù)據(jù)庫，用于指導(dǎo)輔助患者治療。

近期，Perthera公司的研究人員在《Oncotarget》上發(fā)表了一項(xiàng)研究，在胰腺癌患者中比較液體活檢和組織活檢的結(jié)果。他們發(fā)現(xiàn)兩種方法之間存在顯著的不一致性，這表明，目前組織活檢仍然是腫瘤診斷的金標(biāo)準(zhǔn)，液體活檢還不能取代組織活檢。

胰腺癌患者中的液體活檢和組織活檢結(jié)果不一致

首先，研究人員使用兩種基于血液的NGS檢測方法分析34名胰腺癌患者：其中26名患者接受Guardant Health公司的Guardant360檢測，該檢測基于Illumina HiSeq 2500平臺對cfDNA進(jìn)行68-基因panel進(jìn)行測序；8名患者接受Cynvenio公司的ClearID檢測，該檢測基于Thermo Fisher IonTorrent PGM平臺上對50個基因進(jìn)行panel測序。此外，在這34名患者中，23名患者使用Foundation Medicine的FoundationOne進(jìn)行腫瘤組織活檢，該檢測基于Illumina HiSeq 2500平臺對321個基因進(jìn)行panel測序。

結(jié)果顯示，液體活檢在19名患者中平均檢測了2個基因突變，而組織活檢在每名患者中平均檢測到13個基因突變，造成該結(jié)果的原因可能是由于組織活檢所檢測的基因較多。

研究人員還在同時接受了液體活檢和組織活檢的23名患者中比較了胰腺癌中四種常見突變基因的結(jié)果。他們發(fā)現(xiàn)9名患者（39%）的KRAS變異結(jié)果較一致，但是液體活檢并沒有發(fā)現(xiàn)組織活檢所檢測到的14個KRAS變異;同時，6名患者（26%）的TP53變異結(jié)果較一致，但是血液檢測并沒有發(fā)現(xiàn)組織活檢所檢測到的15個TP53變異；另外，血液活檢沒有檢測到CDKN2A或SMAD4突變，而組織活檢分別在11名和6名患者中檢測到這兩種突變。

文章作者Petricoin說，由于 KRAS突變發(fā)生在約90%的胰腺癌患者中，該突變的結(jié)果能說明一項(xiàng)檢測的敏感性，因此，KRAS結(jié)果的不一致需要引起足夠重視。

然而，Guardant Health的高級醫(yī)療主管和實(shí)驗(yàn)室主任Justin Odegaard表示，這項(xiàng)研究中的患者并不適合用Guardant360檢測來分析。該研究中幾乎所有的受試者在液體活檢前都接受了化療，這種治療可能對cfDNA的水平具有強(qiáng)烈的影響，而且部分受試者對目前的治療已經(jīng)產(chǎn)生反應(yīng)或病情趨于穩(wěn)定。Guardant360檢測的目的是用來為患者選擇治療方法，主要用于剛開始接受治療或病情進(jìn)展后考慮更換治療方法的患者。

接下來，研究者分析了17名具有較高腫瘤負(fù)擔(dān)和病情進(jìn)展的患者發(fā)現(xiàn)，液體活檢檢測到KRAS突變的比例有所提高：41%（17名中的7名）VS 29%（34名中的10名），但還是低于預(yù)期。相比之下，這17名患者中有9名進(jìn)行了組織活檢，其中7名中檢測到KRAS突變（78%）。

Petricoin表示，盡管該研究中觀察到的液體活檢和組織活檢結(jié)果不一致，然而，尤其是對組織活檢較難操作的腫瘤而言，液體活檢仍然是患者腫瘤信息的重要來源。

參考文獻(xiàn)：A pilot study evaluating concordance between blood-based and patient-matched tumor molecular testing within pancreatic cancer patients participating in the Know Your Tumor (KYT) initiative. DOI:10.18632/oncotarget.13225

來源：測序中國